Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtlP38585 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms