Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk2P38575 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms