Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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