Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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