Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NapbP28663 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NapbP28663 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NapbP28663 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms