Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpbP27048 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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