Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms