Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18532 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18532 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms