Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18530 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18530 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18530 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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