Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtcP11725 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtcP11725 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms