Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms