Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P10404 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P10404 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P10404 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P10404 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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