Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Igsf6P0C6B7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igsf6P0C6B7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Igsf6P0C6B7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms