Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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