Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CrxO54751 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CrxO54751 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CrxO54751 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CrxO54751 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
CrxO54751 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CrxO54751 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CrxO54751 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CrxO54751 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms