Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
EdaO54693 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
EdaO54693 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
EdaO54693 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
EdaO54693 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
EdaO54693 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
EdaO54693 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms