Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms