Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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