Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
EllO08856 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
EllO08856 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
EllO08856 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
EllO08856 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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