Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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