Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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