Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScaperF8VQ70 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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