Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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Defa35E9QLQ1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa35E9QLQ1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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