Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6685D3YYP3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6685D3YYP3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6685D3YYP3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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