Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syce3B5KM66 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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