Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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