Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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