Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pm20d2A3KG59 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms