Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms