Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms