Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26992S4R1A3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26992S4R1A3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms