Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms