Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sema6cQ9WTM3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms