Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms