Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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