Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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