Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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