Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf138rt1Q9D9M9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Rnf138rt1Q9D9M9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf138rt1Q9D9M9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf138rt1Q9D9M9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf138rt1Q9D9M9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf138rt1Q9D9M9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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