Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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