Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc7Q9D541 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7Q9D541 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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