Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Lrrc17Q9CXD9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Lrrc17Q9CXD9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Lrrc17Q9CXD9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Lrrc17Q9CXD9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Lrrc17Q9CXD9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Lrrc17Q9CXD9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Lrrc17Q9CXD9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Lrrc17Q9CXD9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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