Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms