Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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