Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms