Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Med28Q920D3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms