Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Klhdc3Q8VEM9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Klhdc3Q8VEM9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Klhdc3Q8VEM9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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