Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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