Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Med17Q8VCD5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Med17Q8VCD5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Med17Q8VCD5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med17Q8VCD5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms