Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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OptnQ8K3K8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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