Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms